Статьи журнала - Вестник Пермского университета. Серия: Биология

Все статьи: 846

Скрининг гена альфа-субъединицы бензоат диоксигеназы в бактериальных ассоциациях, полученных в результате селекции на (хлор)ароматических соединениях

Скрининг гена альфа-субъединицы бензоат диоксигеназы в бактериальных ассоциациях, полученных в результате селекции на (хлор)ароматических соединениях

Егорова Дарья Олеговна, Пьянкова Анна Александровна

Статья научная

Показано, что в тотальной ДНК шести бактериальных ассоциаций, полученных в результате накопительного культивирования в присутствии бифенила/хлорированных бифенилов, обнаружены фрагменты гена benA, кодирующего альфа-субъединицу бензоат диоксигеназы. В результате филогенетического анализа нуклеотидных последовательностей амплифицированных фрагментов гена benA установлено, что большинство изученных фрагментов формируют кластеры с гомологичными генами представителей отдела/филума Proteobacteria, уровень сходства при этом составил 100%. Уровень сходства с benA-генами известных грамотрицательных штаммов-деструкторов составил 79.5-89.7%. В ассоциации CHN4 выявлен ген benA, формирующий единый кластер с геном benA штаммов рода Rhodococcus, и на 96% схожий с гомологичным геном штамма-деструктора R. jostii RHA1.

Бесплатно

Скрининг и изучение ключевых генов катаболизма бифенила и полихлорированных бифенилов у аэробных бактерий

Скрининг и изучение ключевых генов катаболизма бифенила и полихлорированных бифенилов у аэробных бактерий

Шумковa Е.С., Ананьина Л.Н., Плотникова Е.Г.

Статья научная

Методом полимеразной цепной реакции проведен скрининг бактерий-деструкторов бифенила на наличие гена bphA1, кодирующего a-субъединицу бифенил диоксигеназы, ключевого фермента разложения бифенила и полихлорированных бифенилов (ПХБ). Анализ нуклеотидных последовательностей показал высокий уровень сходства (98%) участка гена bphA1 длиной около 500 п.н. исследуемых штаммов рода Rhodococcus и известных бактерийдеструкторов того же рода. Показан высокий уровень сходства гена bphA1 грамотрицательных штаммов родов Pseudomonas и Comamonas и активных деструкторов ПХБ рода Pseudomonas (99-100%). Выявлены бактерии, у которых нуклеотидные последовательности, кодирующие a-субъединицу бифенил диоксигеназы, существенно отличаются от описанных в литературе.

Бесплатно

Снижение колонизации полидиметилсилоксана Staphylococcus epidermidis

Снижение колонизации полидиметилсилоксана Staphylococcus epidermidis

Карпунина Т.И., Якушева Д.Э., Кисельков Д.М., Борисова И.А., Якушев Р.М.

Статья научная

Проведена модификация поверхности полидиметилсилоксана (ПДМС) комбинированным физико-химическим методом. Метод заключается в ионно-лучевой обработке с последующей прививкой акриловой кислоты и взаимодействии с химическими реагентами. Предполагается, что в результате модифицирования на поверхности появляются аминогруппы и координационно-связанные с аминогруппами ионы цинка. Методом сканирующей электронной микроскопии изучено образование биопленок клиническим штаммом Staphylococcus epidermidis на исходной и модифицированной поверхностях. Полученные результаты свидетельствуют о значительном снижении микробной контаминации модифицированной поверхности (ПДМС). Возможно применение предложенного способа для антибактериальной обработки медицинских изделий из силиконового каучука.

Бесплатно

Снижение фитотоксичности кадмия с использованием Rhodococcus-биосурфактантов

Снижение фитотоксичности кадмия с использованием Rhodococcus-биосурфактантов

Тищенко Артм Валерьевич, Литвиненко Людмила Викторовна, Ившина Ирина Борисовна

Статья научная

Изучено влияние кадмия на прорастание семян сельскохозяйственных растений: вики полевой (Vicia sativa L.), горчицы белой (Sinapis alba L.) и овса посевного (Avena sativa L.) в присутствии Rhodoccocus-биосурфактантов. Биосурфактанты способствуют ослаблению негативного воздействия кадмия за счёт их десорбции от компонентов почвы с последующим образованием стабильных комплексов «биосурфактант-металл», а также стимулируют рост корневой системы растений. Кадмий в концентрации 50 ПДК и выше оказывает выраженное угнетающее действие на прорастание семян. Обработка семян и их прорастание в присутствии биосурфактантов способствуют значительному (от 1.2 до 8.7 раз) увеличению всхожести, энергии прорастания и жизнеспособности проростков в условиях загрязнения среды солями кадмия. Разработан экологически безопасный способ снижения токсического действия кадмия на рост сельскохозяйственных культур растений: Avena sativa L., Sinapis alba L. и Vicia sativa L. в присутствии Rhodococcus-биосурфактантов.

Бесплатно

Совместимые вещества штамма Halomonas sp. SMB31, синтезируемые в ответ на осмотический стресс

Совместимые вещества штамма Halomonas sp. SMB31, синтезируемые в ответ на осмотический стресс

Ананьина Людмила Николаевна, Горбунов Алексей Аркадьевич, Шестакова Елена Анатольевна

Статья научная

Исследование физиологии штамма Halomonas sp. SMB31 показало, что он рос в минеральной среде Раймонда с глюкозой (1 г/л) в качестве субстрата в широком диапазоне концентраций хлорида натрия 1-20%, с оптимумом роста при 5%-ном NaCl. На основе полученных данных штамм отнесен к группе умеренногалофильных бактерий. Анализ этанольных экстрактов клеток штамма Halomonas sp. SMB31, выращенных в присутствии повышенных концентраций соли (5-, 10-, 15%-ном NaCl), методом ЯМР 1Н показал, что преобладающим совместимым веществом являлся эктоин. Кроме того, в клетках присутствовала глутаминовая кислота. Увеличение солености среды культивирования с 5% до 10% NaCl приводило к накоплению клетками гидроксиэктоина. Установлено, что внутриклеточное количество эктоина штамма Halomonas sp. SMB31 зависело от концентрации хлорида натрия и фазы роста бактериальной культуры.

Бесплатно

Современное состояние макрозообентоса Камского и Боткинского водохранилищ

Современное состояние макрозообентоса Камского и Боткинского водохранилищ

Истомина А.М.

Статья научная

За время исследований (с 2000 по 2016 гг.) в донной фауне Камского и Боткинского водохранилищ зарегистрировано 275 таксонов. Для водохранилищ практически все время их существования были характерны низкие величины кормовой биомассы, в настоящее время средняя биомасса кормовых организмов в водоемах не превышает 5.5 г/м2. Лимитирующим фактором для развития бентофау-ны (особенно в мелководной зоне) является сработка уровня воды, достигающая в осенне-зимний период 78.1% общего объема Камского водохранилища и 40.7% общего объема Боткинского водохранилища. Исключение составляют Сылвенский залив Камского водохранилища и участок глубоководной зоны приплотинного района Боткинского водохранилища, которые, благодаря массовому развитию младшевозрастных особей дрейссенид и ракообразных, можно считать участками с повышенной трофностью.

Бесплатно

Современное состояние материнских и младенческих потерь в Пермском крае

Современное состояние материнских и младенческих потерь в Пермском крае

Зайцева Н.В., Алексеев В.Б., Кирьянов Д.А.

Статья научная

Выполнен углубленный анализ материнской и младенческой смертности в Пермском крае, дан анализ динамики и структуры показателей, рассмотрены вопросы причин превышения уровней потерь соседних регионов и стран. Дана оценка мероприятий, проводимых в крае по предотвращению потерь, связанных с материнской и младенческой смертностью.

Бесплатно

Современное состояние некоторых млекопитающих аридных и семиаридных экосистем западного Азербайджана

Современное состояние некоторых млекопитающих аридных и семиаридных экосистем западного Азербайджана

Кулиев Суджаддин Мирзабаба Оглы, Аскеров Эльшад Кочары Оглы

Статья научная

В рамках проекта «Консервация аридных и семиаридных экосистем Закавказья», финансируе -мого GEF и UNDP, исследованы основные аридные экосистемы республики. Их биотопы представлены полынными полями, островками тугайных лесов, зарослями тамарикса и дер-жи-дерева, можжевелово-фисташковыми редколесьями. На основании литературных данных и собственных исследований анализируется современное экологическое состояние большого подковоноса, леопарда, полосатой гиены, бурого медведя, благородного оленя, джейрана.

Бесплатно

Современное состояние орнитофауны Турянчайского заповедника и прилегающих к нему территорий

Современное состояние орнитофауны Турянчайского заповедника и прилегающих к нему территорий

Гасанова Сувейрат Мамедхан Кызы

Статья научная

Установлено, что современная орнитофауна заповедника и прилегающих территорий включает 113 видов (11 отрядов, 30 семейств и 59 родов). 48 видов (42.4%) - оседлые, 33 вида (29.2%) - прилетающие для размножения, 26 видов (23%) - мигранты, 6 видов (5.3%) -зимующие. Исследованная территория находится на трех ландшафтах. Из 48 оседлых и 33 прилетающих для размножения видов 57 (54.4%) гнездятся в тугайных лесах вдоль рек Ту-рянчай и Геокчай. Все виды входят в список конвенций SITEC, Бонн, Берн, Рамсар и AEWA. 8 видов имеют глобальный, 48 - европейский охранный статус.

Бесплатно

Современные биологические характеристики сига Coregonus lavaretus, европейской ряпушки С. albula и европейской корюшки Osmerus eperlanus озера Имандра

Современные биологические характеристики сига Coregonus lavaretus, европейской ряпушки С. albula и европейской корюшки Osmerus eperlanus озера Имандра

Зубова Е.М., Кашулин Н.А., Терентьев П.М.

Статья научная

Исследованы современные биологические характеристики многочисленных видов рыб плёсов оз. Имандра - сига, европейской ряпушки и европейской корюшки. Показано, что в условиях продолжающегося негативного изменения гидрологического и гидрохимического режимов озера за последние 20 лет, произошли разнонаправленные изменения в структурах популяций этих видов. Если у короткоцикловых видов (корюшка, ряпушка) наблюдается положительная динамика ряда показателей, то у сига эти изменения носят негативный характер. Эврифагия корюшки оз. Имандра, включая переход на хищничество при достижении длины 150 мм, в сочетании с эффективной стратегией размножения и практическим отсутствием пресса хищников, обеспечивают ей высокую численность и успешную конкуренцию с другими видами.

Бесплатно

Современные методы исследования апоптоза с применением проточной цитофлюориметрии

Современные методы исследования апоптоза с применением проточной цитофлюориметрии

Власова Виолетта Викторовна, Сайдакова Евгения Владимировна

Статья научная

В процессе апоптоза - программной гибели - клетка претерпевает ряд консервативных биохимических изменений. Среди них ключевыми событиями являются потеря трансмембранного потенциала митохондрий, активация проапоптотических белков семейства Bcl-2, нарушение липидной асимметрии и повышение проницаемости цитоплазматической мембраны, активация ферментов из семейства каспаз и фрагментация нуклеиновых кислот. Многоцветная проточная цитофлюоримет-рия позволяет детектировать большинство из событий, свидетельствующих об индукции программной гибели клетки, что дает возможность исследования апоптоза на самых ранних его этапах. В настоящей статье описаны основные подходы к детекции апоптоза с применением многоцветной проточной цитофлюориметрии; рассмотрены молекулярные процессы, лежащие в их основе; обозначены преимущества и ограничения в использовании различных методов определения программной гибели клеток в биологии и медицине.

Бесплатно

Современные подходы к анализу механизмов адаптации человека в условиях воздействия химических факторов (аналитический обзор)

Современные подходы к анализу механизмов адаптации человека в условиях воздействия химических факторов (аналитический обзор)

Чигвинцев Владимир Михайлович, Кирьянов Дмитрий Александрович

Статья научная

Проведено исследование методов анализа механизмов адаптации организма человека к действию факторов среды обитания, отмечена специфичность каждого из них.

Бесплатно

Современные эколого-эпизоотологические и эпидемиологические особенности природных очагов бешенства в Омской области

Современные эколого-эпизоотологические и эпидемиологические особенности природных очагов бешенства в Омской области

Савкина Екатерина Сергеевна, Полещук Елена Михайловна, Сидоров Геннадий Николаевич

Статья научная

Проведено изучение современных эколого-эпизоотологических и эпидемиологических особенностей заболеваний бешенством в Омской обл. в начале XXI в., традиционно неблагополучной по этой инфекции. Охарактеризованы заболевания людей бешенством в Омской обл. с 1962 г. и установлены особенности обращения населения за антирабической помощью после травматических контактов с животными за 2001-2020 гг. Изучены особенности эпизоотического процесса в этот период. Проанализирована численность лисицы и енотовидной собаки - основных природных хозяев и распространителей бешенства. Выявлены индекс эпизоотичности и плотности инфекции в разных районах области. Выполнено современное эпидемиологическое районирование и установлен риск заболеваемости бешенством в разных районах Омской обл. Установлено, что в начале XXI в. эпизоотический процесс бешенства на территории области претерпел значительные изменения. Число выявляемых заболеваний животных имеет тренд к выраженному снижению. Эпизоотии формируют стойкие очаги, локализующиеся в изучаемый период преимущественно в подзоне северной лесостепи. Эта ранее не наблюдаемая особенность ландшафтной приуроченности очагов, по-видимому, связана с изменением структуры населения природных хозяев инфекции и значительным ростом численности енотовидной собаки. Установлено, что для оптимизации профилактических мероприятий требуется уделить внимание вакцинации всех групп животных, вовлечённых в эпизоотический процесс, продолжать оральную вакцинацию диких хищников. Существуют условия для формирования стойких природных очагов инфекции и возможности активизации эпизоотий. Это обусловливает актуальность постоянного мониторинга плотности популяций и спонтанной заражённости вирусом бешенства лисицы, енотовидной собаки, корсака и барсука.

Бесплатно

Современный статус краснокнижных видов хищных и травоядных млекопитающих Азербайджана

Современный статус краснокнижных видов хищных и травоядных млекопитающих Азербайджана

Кулиев Суджаддин Мирзабаба Оглы, Аскеров Эльшад Кочары Оглы

Статья научная

В основу этого сообщения легли материалы, собранные в основных местах обитания леопарда, рыси, полосатой гиены, бурого медведя, косули, благородного оленя, джейрана, серны, безоарового козла и муфлона в Азербайджане. Были обсуждены статус, прежний и современный ареалы, причина сокращения ареала и численности, меры по сохранению этих видов в стране. Работы проводились при финансовой поддержке Фонда развития науки при Президенте Азербайджана.

Бесплатно

Содержание минеральных элементов, пигментов и низкомолекулярных антиоксидантов в листьях Tilia cordata Mill. в транспортной зоне урбанизированных экосистем

Содержание минеральных элементов, пигментов и низкомолекулярных антиоксидантов в листьях Tilia cordata Mill. в транспортной зоне урбанизированных экосистем

Кайгородов Р.В., Попова Е.И.

Статья научная

Листья липы мелколистной (Tilia cordata L.) отбирали в участках транспортной зоны городских территорий вдоль главных и второстепенных дорог; в качестве контроля использовали листья из пешеходной зоны. Проведено исследование содержания минеральных элементов, пигментов - хло-рофиллов a и b, низкомолекулярных антиоксидантов - восстановленные формы аскорбиновой кислоты и глутатиона. Валовое содержание макро-, микроэлементов и токсичных элементов в листьях определяли методом оптической эмиссионной спектрометрии с индуктивно связанной плазмой; количественное содержание хлорофиллов - в ацетоновой вытяжке спектрофотометрическим методом. Общее содержание аскорбиновой кислоты и глутатиона анализировали методом высокоэффективной жидкостной хроматографии; общую редуцирующую активность - путем титрования растительных вытяжек раствором йодата калия в стандартных условиях. Установлено повышенное накопление макро-, микроэлементов и тяжелых металлов в листьях липы в транспортной зоне. Показано изменение содержания и соотношения хлорофиллов a и b, а также низкомолекулярных ан-тиоксидантов в листьях растений транспортной зоны по сравнению с этими показателями в пешеходной. Изученные нами физиолого-биохимические свойства листьев липы проявляют высокую взаимосвязь с антропогенным воздействием в транспортной зоне урбанизированных экосистем.

Бесплатно

Содержание пигментов в растениях Lepidium sativum в условиях хлоридно-натриевого засоления и ощелачивания

Содержание пигментов в растениях Lepidium sativum в условиях хлоридно-натриевого засоления и ощелачивания

Еремченко О.З., Кусакина М.Г., Лузина Е.В.

Статья научная

Представлены результаты исследований влияния засоления и ощелачивания корневого субстрата на ростовые процессы и пигментный аппарат растений кресс-салата (Lepidium sativum L., Brassicaceae). Показано, что повышение содержания фотосинтетических пигментов в листьях способствует адаптации растений к действию неблагоприятных факторов среды. Установлены корреляции между высотой, массой растений и содержанием в них хлорофиллов и каротиноидов.

Бесплатно

Содержание продуктов перекисного окисления липидов и антиоксидантных ферментов в плазме крови сукрольных и лактирующих самок кролика

Содержание продуктов перекисного окисления липидов и антиоксидантных ферментов в плазме крови сукрольных и лактирующих самок кролика

Тарасов С.С., Корягин А.С.

Статья научная

Исследовали состояние перекисного окисления липидов по содержанию малонового диальдегида и диеновых конъюгатов, и антиоксидантных ферментов: каталазы и супероксиддисмутазы в плазме крови сукрольных, лактирующих и не сукрольных самок кролика. Показано, что многие из исследуемых параметров имеют уникальную динамику в зависимости от стадии беременности или лактации. Приводится анализ полученных данных в связи с биологическими особенностями окислительного метаболизма животных и их адаптационными возможностями.

Бесплатно

Содержание различных форм фосфора у галофитов с различными механизмами регуляции солевого обмена

Содержание различных форм фосфора у галофитов с различными механизмами регуляции солевого обмена

Кусакина М.Г., Орлова Н.В., Ошева Т.В.

Статья научная

Установлено, что галофиты, имеющие разные механизмы адаптации к засолению почвы, характеризуются более существенными различиями в содержании кислоторастворимых органических фосфатов по сравнению с фосфолипидами и фосфопротеинами.

Бесплатно

Солевой обмен растений в условиях техногенного засоления

Солевой обмен растений в условиях техногенного засоления

Еремченко О.З., Лымарь О.А., Орлова Н.В.

Статья научная

Синантропные представители местной флоры, адаптировавшиеся к техногенному засолению возле солеотвалов, характеризуются повышенным содержанием засоляющих ионов, перераспределением хлоридов с преимушественным накоплением в надземных органах, существенной избирательностью поглощения по отношению к ионам Na, С1, К и снижением активности ионов водорода в клетках.

Бесплатно

Сопряжение данных инструментальной и расчетной оценки качества атмосферного воздуха г. Перми для задач эколого-гигиенического зонирования территории

Сопряжение данных инструментальной и расчетной оценки качества атмосферного воздуха г. Перми для задач эколого-гигиенического зонирования территории

Май И.В., Вековшинина С.А., Чигвинцев В.М.

Статья научная

Предложен и апробирован метод верификации модельных данных о загрязнении, полученных на базе сводных расчетов рассеивания по территории, и данных натурных наблюдений с постов экологического мониторинга. Метод апробирован на примере загрязнения атмосферы г. Перми диоксидом азота. Получены поля концентраций диоксида азота, которые верифицированы данными натурных наблюдений. Проведено гигиеническое зонирование территории города.

Бесплатно

Журнал