Статьи журнала - Вестник Пермского университета. Серия: Биология

Все статьи: 846

Разработка способа индикации и идентификации Vibrio parahaemolyticus с помощью real-time ПЦР

Разработка способа индикации и идентификации Vibrio parahaemolyticus с помощью real-time ПЦР

Полеева Марина Владимировна, Чемисова Ольга Сергеевна, Трухачев Алексей Леонидович

Статья научная

Бактерии Vibrio parahaemolyticus могут быть причиной возникновения острого кишечного заболевания у людей, протекающего по типу пищевой токсикоинфекции. Успех лечебно-профилактических и санитарно-противоэпидемических мероприятий, направленных на предотвращение распространения «галофилезов», во многом зависит от своевременной точной идентификации штаммов вибрионов, выделяемых от больных, из морепродуктов и при мониторинге объектов окружающей среды. Представлена разработка способа идентификации штаммов вида V. parahaemolyticus методом ПЦР в режиме «реального времени» (Real-Time PCR), который включает выделение хромосомной ДНК из исследуемого материала, постановку ПЦР со сконструированными нами праймерами, специфичными к участку гена коллагеназы vppC, и зондом, позволяющим детектировать амплифицированный фрагмент и проводить учет полученных результатов в режиме реального времени. Показана возможность индикации и идентификации микроорганизмов вида V. parahaemolyticus при исследовании проб биологического материала (рыба, морепродукты) на основе метода Real-Time PCR.

Бесплатно

Распространение бактерий, обладающих системами трансформации нитрилов и эфиров, в почвах умеренной и степной зоны

Распространение бактерий, обладающих системами трансформации нитрилов и эфиров, в почвах умеренной и степной зоны

Кузнецова М.В., Максимова А.В., Ремезовская Н.Б., Максимов А.Ю.

Статья научная

В почвенных образцах исследован состав бактерий, трансформирующих нитрилы и эфиры. Количество бактерий, трансформирующих нитрилы, в разных почвах колебалось от 1105 до 3,64107, эфиры - от 2,0104 до 8,21107. Показано, что большее количество бактерий, утилизирующих альдоксимы, нитрилы и амиды, содержится в дерново-луговых почвах, а эфиры - в степных почвах с повышенным засолением. Установлено, что большинство нитрилметаболизирующих изолятов устойчиво к высоким концентрациям исследованных субстратов (0,5 М и более). Токсичность для них возрастала в ряду ацетамид-ацетонитрил-ацетальдоксим. Эфирутилизирующие бактерии росли при высоких концентрациях этилацетата (более 1 М). Выделены культуры бактерий с высокой активностью ферментов нитрилгидратазы, амидазы и эстеразы, перспективные для биотехнологии комплексной очистки сточных вод и химическимодифицированной почвы.

Бесплатно

Распространение и состояние природных популяций Dianthus acicularis Fisch. ex Ledeb. в Пермском крае

Распространение и состояние природных популяций Dianthus acicularis Fisch. ex Ledeb. в Пермском крае

Ефимик Елена Герасимовна, Копытов Максим Иванович

Статья научная

Изучено распространение гвоздики иглолистной (Dianthus acicularis Fisch. ex Ledeb., Caryophyllaceae) на территории Пермского края. Выявлены новые местонахождения вида; приведены численность и плотность вида в данных ценопопуляциях.

Бесплатно

Распространение и эколого-ценотическая приуроченность дикорастущих пищевых видов рода Sorbus L. (Rosaceae) на острове Cахалин

Распространение и эколого-ценотическая приуроченность дикорастущих пищевых видов рода Sorbus L. (Rosaceae) на острове Cахалин

Денисова Янина Вячеславовна, Красикова Валентина Ильинична, Попова Яна Павловна, Перунова Елена Анатольевна

Статья научная

Выполнены исследования с целью уточнения распространения и мест обитания на о-ве Сахалин двух видов дикорастущих пищевых растений рода Sorbus L. (S. sambucifolia (Cham. et Schlecht.) M. Roem., S. sibirica Hedl.). S. sambucifolia - летнезеленый кустарник высотой 1.0-2.5 м. S. sibirica - летнезеленое дерево до 10 м высотой. Кустарниковая рябина встречается по всему о-ву Сахалин, является доминантом и субдоминантом кустарникового яруса лесных фитоценозов (елово-пихтовых, пихтово-еловых, лиственничных, каменноберезовых, белоберезовых, кедровостланиковых), а также в подгольцовых зарослях, во вторичных фитоценозах на местах рубок и гарей; она отличается сравнительно широким фитоценотическим спектором. S. sibirica ограничена в распространении лесными фитоценозами (елово-пихтовые, лиственничные и каменноберезовые сообщества) севера о-ва Сахалин. Картографирование мест произрастания рябин на острове проводилось с применением программного комплекса ArcGIS Desktop 10 в базовом приложении ArcMap. Полученные в ходе исследования данные о местах произрастания пищевых рябин являются эффективным инструментом планирования и проведения мероприятий по рациональному использованию островных дикорастущих пищевых видов. Результаты исследования могут послужить материалом для актуализации ресурсоведческих данных.

Бесплатно

Распространение нитрилконвертирующих бактерий в почвах Пермского края

Распространение нитрилконвертирующих бактерий в почвах Пермского края

Кузнецова М.В., Овечкина Г.В., Максимов А.Ю., Демаков В.А.

Статья научная

Проведен скрининг микрофлоры, утилизирующей нитрилы карбоновых кислот, в подзолистых, бурых и аллювиальных почвах, широко распространенных в Пермском крае. Обнаружено, что культуры бактерий, обладающие высокой нитрилазной активностью, в основном представлены грамотрицательными штаммами, а среди культур, продуцирующих нитрилгидратазы, преобладают нокардиоподобние актиномицеты. Выявлены сезонные колебания численности бактерий, проявляющих нитрилгидратазную и нитрилазную активность.

Бесплатно

Распространение рыб в малых озерах горной полосы бассейна р. Косью (Приполярный Урал)

Распространение рыб в малых озерах горной полосы бассейна р. Косью (Приполярный Урал)

Пономарев Василий Иванович

Статья научная

Впервые исследовано рыбное население малых горных озер бассейна верховьев р. Косью (приток II порядка р. Печоры). Чрезвычайно высокие уклоны и скорости течения реки, климатические особенности западных склонов Приполярного Урала и небольшие размеры большинства озер определяют специфику условий обитания рыб. Всего обнаружено семь видов, относящихся к пяти семействам: арктический голец, щука, обыкновенный и озерный гольяны, плотва, налим и окунь. Условия среды обитания в озерах на высоте 300-600 м над ур. м. существенно сказались как на скудности состава ихтиофауны, так и на структуре рыбного населения. За редким исключением, озера населены либо одним видом рыб, либо двумя, из которых один абсолютно доминирует по численности. Для большинства видов рыб характерна чрезвычайно низкая величина показателя относительной плотности; максимальные его значения демонстрируют плотва и окунь. В ряде озер выявлены тугорослые группировки арктического гольца, плотвы и налима. Определяющей закономерностью распространения рыб в озерах горной области бассейна р. Косью является высота над уровнем моря и наличие или отсутствие водной растительности.

Бесплатно

Растения, включенные в Красную книгу Пермской области, выявленные во флоре центральных районов Пермской области (Краснокамский и Пермский)

Растения, включенные в Красную книгу Пермской области, выявленные во флоре центральных районов Пермской области (Краснокамский и Пермский)

Агафонцева А.В.

Статья научная

На основании анализа флористических сводок из района исследования, гербарных коллекций Гербария Пермского государственного университета (PERM) и собственных гербарных сборов во флоре центральных районов Пермской области выявлены 32 вида растений, относящихся к 24 родам и 10 семействам, которые занесены в Красную книгу Пермской области. Из них в Красную книгу СССР включены 6, в Красную книгу РСФСР - 8, в Красную книгу Среднего Урала - 28 видов.

Бесплатно

Растительность ООПТ "Большеситовское болото" (Пермский край)

Растительность ООПТ "Большеситовское болото" (Пермский край)

Ефимик Е.Г.

Статья научная

Приведены итоги изучения растительности особо охраняемой природной территории «Большеситовское болото». На территории обследованного участка выявлено несколько типов лесных, луговых и болотных ассоциаций. Преобладающими типами леса на данной территории являются светлохвойные (сосновые леса): сосняки зеленомошные (сосняки-брусничники и сосняки-черничники), сосняки сфагновые; отмечены небольшие участки мохово-лишайниковых сосняков. Темнохвойные леса представлены ельниками-зеленомошниками, ельниками хвощевыми, ельниками сфагновыми, пихтово-еловыми крупнопапоротниковыми и пихтово-еловыми зеленомошными ассоциациями. Встречены сосново-еловые зеленомошные леса. Из смешанных лесов встречаются сосново-березовые и березово-сосновые леса, елово-березовые травяные и хвощевые ассоциации. Болота представлены верховым, низинным и переходным типами. Луговая растительность присутствует только на нарушенных человеком участках и в пойме р. Яйвы (очень небольшие участки пойменных лугов). В зависимости от степени увлажнения на нарушенных участках формируются пустошные и заболоченные луга (близкие к низинным или к верховым болотам).

Бесплатно

Растительный покров охраняемого ландшафта «Ладейный лог»

Растительный покров охраняемого ландшафта «Ладейный лог»

Овеснов Сергей Александрович

Статья научная

Излагаются результаты изучения флоры и растительности ООПТ «Ладейный лог» (окрестности г. Губахи Пермского края).

Бесплатно

Региональная программа мониторинга врожденных пороков развития у детей в Пермском крае

Региональная программа мониторинга врожденных пороков развития у детей в Пермском крае

Алпатова М.А., Маклакова О.А., Устинова О.Ю., Евсеева Т.Н.

Статья научная

Представлены частота, структура и распространенность врожденных пороков развития (ВПР) у детей Пермского края по результатам мониторинга ВПР за 15-летний период (2000-2015 гг.). Установлено, что частота ВПР в Пермском крае за анализируемый период была в 1,5 раза выше общероссийского показателя и составила 33.87%о. Показано, что в структуру врожденных пороков наибольший вклад вносят аномалии развития системы кровообращения. Сравнительная оценка частоты отдельных нозологических форм пороков, подлежащих обязательной регистрации, выявила, что в Пермском крае спинно-мозговая грыжа у новорожденных детей диагностировалась в 2.5 раза чаще, чем в регионах Российской Федерации, а микроотия в 1.7 раза превышала данные Европейского международного регистра врожденных пороков развития.

Бесплатно

Регуляторная роль фотооксидазной реакции в работе циклической редокс-цепи интактных хроматофоров пурпурной бактерии Rhodospirillum rubrum

Регуляторная роль фотооксидазной реакции в работе циклической редокс-цепи интактных хроматофоров пурпурной бактерии Rhodospirillum rubrum

Гирва М.В., Белевич И.О., Ременников В.Г.

Статья научная

Установлено, что в аэробных условиях в результате оттока электронов на кислород и в анаэробных условиях в присутствии донора электронов наблюдается ингибирование генерации мембранного потенциала, которое устраняется в первом случае при создании анаэробных условий вследствие добавления субстратов окисления фотооксидазной реакции (сукцината), а во втором ~ при возникновении акцепторов электронов, устраняющих чрезмерное восстановление компонентов циклической редокс-цепи (фумарат, О2, ТеОз^")- Полученные данные иллюстрируют регуляторную роль фотооксидазной реакции в генерации мембранного потенциала, обусловленной работой циклической редокс-цепи клеточных хроматофоров К rubrum.

Бесплатно

Регуляция лептином и грелином апоптоза CD4+-лимфоцитов in vitro

Регуляция лептином и грелином апоптоза CD4+-лимфоцитов in vitro

Орлова Е.Г., Ширшев С.В.

Статья научная

Изучены эффекты лептина и грелина в концентрациях, сопоставимых с содержанием гормонов в периферической крови при беременности, в регуляции апоптоза ОВ4 +-лимфоцитов перифери­ческой крови в системе in vitro.

Бесплатно

Регуляция лептином и грелином продукции интерферона и интерлейкина-4 в системе in vitro

Регуляция лептином и грелином продукции интерферона и интерлейкина-4 в системе in vitro

Орлова Екатерина Григорьевна, Ширшев Сергей Викторович

Статья научная

Изучены эффекты лептина и грелина в концентрациях, сопоставимых с содержанием гормонов в периферической крови при беременности, на синтез интерферона- ° и интерлейкина-4 в культуре мононуклеарных лейкоцитов и Т-лимфоцитами периферической крови in vitro.

Бесплатно

Регуляция лептином и грелином экспрессии мембранных молекул и продукции цитокинов натуральными T-регуляторными клетками

Регуляция лептином и грелином экспрессии мембранных молекул и продукции цитокинов натуральными T-регуляторными клетками

Орлова Е.Г., Ширшева С.В., Логинова О.А.

Статья научная

Изучены эффекты лептина и грелина, и их комбинаций в концентрациях, характерных для беременности, на экспрессию мембранных молекул (CTLA-4, GITR, GARP) и продукцию цитокинов (IL-10, TGF-рЧ) в культуре натуральных Т-регуляторных клеток in vitro.

Бесплатно

Регуляция фенотипического созревания NK и NKT клеток гормонами репродукции

Регуляция фенотипического созревания NK и NKT клеток гормонами репродукции

Ширшев С.В., Некрасова И.В., Орлова Е.Г.

Статья научная

Установлено, что главная роль в снижении числа CD3-CD16+ клеток в крови женщин в I триместре беременности принадлежит эстриолу и прогестерону (Pr). Повышение уровня NK клеток в III триместре обусловлено Pr, стимулирующий эффект которого негативно контролируется лептином. Аналогичная тенденция выявлена в отношении регуляции процентного содержания NKT клеток гормонами репродукции: снижение уровня данных клеток в I триместре под действием хорионического гонадотропина и повышение к концу беременности под влиянием лептина и эстрадиола.

Бесплатно

Редкие и находящиеся под угрозой исчезновения виды степной флоры Кемеровской области

Редкие и находящиеся под угрозой исчезновения виды степной флоры Кемеровской области

Ротькина Екатерина Борисовна, Шереметова Светлана Анатольевна

Статья научная

Основным объектом исследования являются редкие виды степной флоры Кемеровской обл. Приведен список редких видов по категориям статуса редкости. Проанализированы два издания Красной книги Кемеровской обл. (2000 и 2012 гг.). Проведено сравнение с Красными книгами сопредельных территорий Томской и Новосибирской обл. Даны рекомендации для третьего издания Красной книги Кемеровской обл. по исключению и добавлению видов в список редких и исчезающих.

Бесплатно

Редкие и охраняемые виды заповедника "Вишерский"

Редкие и охраняемые виды заповедника "Вишерский"

Белковская Т.П., Безгодов А.Г.

Статья научная

Проведен анализ распространения 35 видов растений, включенных в красные книги (1996 и 2002). Установлено, что восемь из них не являются редкими и не нуждаются в особой охране на территории заповедника. Помимо оставшихся 27 видов ("краснокнижников"), выявлен еще 101 действительно редкий вид, из которых 43 предложены к включению в готовящееся издание Красной книги Пермской области. Общее число видов растений, подлежащих строгой охране на территории заповедника, составит 70.

Бесплатно

Редкие флористические находки в бассейне реки Оки в Нижегородской области

Редкие флористические находки в бассейне реки Оки в Нижегородской области

Казакова М.В., Баранова О.Г.

Статья научная

Многолетние исследования бассейна р. Оки мало затрагивали восточную часть бассейна, изучение которой было предпринято в 2019 г. Обследованы окрестности ряда населенных пунктов Ардатовского, Вачского, Кулебакского, Навшинского и Сосновского р-нов Нижегородской обл. В результате их было сделано много интересных флористических находок. В статье приведены сведения о 25 редких видах сосудистых растений. Выявлены новые местонахождения для 9 видов, занесенных в региональную Красную книгу, есть виды, которые находятся на границе ареала.

Бесплатно

Результаты выявления поливирулентных штаммов бактерий Lactobacillus spp. при ассоциативном взаимодействии с простейшими Blastocystis hominis in vivo

Результаты выявления поливирулентных штаммов бактерий Lactobacillus spp. при ассоциативном взаимодействии с простейшими Blastocystis hominis in vivo

Красноперова Юлия Юрьевна, Мехманова Севиндж Шахмирзаевна, Хуснатдинова Екатерина Александровна

Статья научная

Выявлены поливирулентные штаммы бактерий Lactobacillus spp. при ассоциативном взаимодействии с простейшими Blastocystis hominis in vivо. Штаммы Lactobacillus spp. и B. hominis выделяли из фекалий 396 пациентов, проходивших анализ на кишечный дисбиоз. Идентификацию бактерий проводили с использованием микроскопического, бактериологического и паразитологического методов. В качестве контрольных использовали 112 эталонных штаммов лактобактерий NK1 и К3Ш24, депонированных в ВНИИ генетики и селекции промышленных микроорганизмов. Степень вирулентности простейших бластоцист определяли путем внутрибрюшинного введения белым мышам (массой 17.4+1.5 г) 0.5 мл взвеси культуры изучаемых микроорганизмов, полученной на питательной среде Suresh. В работе использовали праймеры к нескольким генам, определяющим способность к образованию фимбрий 1-го типа, S и Р типа, бактериального адгезина интимина и гемолизина. Тестирование 396 штаммов Lactobacillus spp., изолированных из микросимбиоценозов с Blastocystis hominis различной степени вирулентности показало, что динамика выявления генов патогенности у лактобактерий возрастала с усилением степени вирулентности простейших. Чаще всего в общем пуле штаммов лактобактерий искомые ампликоны выявлялись при использовании праймеров к fimA гену (до 67.9%). При ассоциативном взаимодействии с умеренно- и высоковирулентными бластоцистами выявлено усиление гетерогенности популяции лактобактерий, проявляющееся увеличением частоты обнаружения всех изученных генетических детерминант патогенности, по сравнению со штаммами Lactobacillus spp., выделенными из ассоциаций с авирулентными B. hominis и в контрольной группе.

Бесплатно

Рекомендуемые к охране виды жужелиц (Coleoptera, Carabidae) Пермского края

Рекомендуемые к охране виды жужелиц (Coleoptera, Carabidae) Пермского края

Воронин А.Г.

Статья обзорная

Приводится критический анализ литературы по охраняемым видам жужелиц Пермского края. На основании литературных данных и собственных полевых исследований рекомендованы к охране в условиях Пермского края шесть видов жужелиц: Carabus loschnikovi F.-W., C. schoenherri F.-W., Pterostichus kaninensis Popp., P. archangelicus Popp., Chlaenius tibialis Dej., Brachinus crepitans L.

Бесплатно

Журнал