Проблема выбора биологического материала в эпигенетических исследованиях психологических характеристик
Автор: Фекличева Инна Викторовна, Чипеева Надежда Александровна, Ковас Юлия Владимировна, Солдатова Елена Леонидовна
Журнал: Психология. Психофизиология @jpps-susu
Рубрика: Краткие сообщения
Статья в выпуске: 3 т.10, 2017 года.
Бесплатный доступ
Поскольку мозговая ткань при жизни непосредственно недоступна для эпигенетических исследований психологических признаков и психопатологий необходимо оценить, какие периферийные ткани наиболее адекватны для достижения целей таких исследований. Представлен анализ публикаций, в которых проводилось сравнение профиля ДНК-метилирования в различных периферических тканях (цельная и пуповинная кровь, плацента, сперма, буккальный эпителий) и посмертных образцах мозговой ткани. Результаты анализа позволяют предположить, что для исследования роли эпигенетических факторов в психологических фенотипах слюна является более предпочтительным материалом для выделения ДНК и последующего анализа ДНК-метилирования по сравнению с клетками крови. Вместе с тем установлено, что для разных фенотипов оптимальными могут являться разные ткани.
Эпигенетические модификации, днк-метилирование, эпигенетика, периферические ткани, психологические фенотипы
Короткий адрес: https://sciup.org/147160075
IDR: 147160075 | DOI: 10.14529/psy170309
Список литературы Проблема выбора биологического материала в эпигенетических исследованиях психологических характеристик
- Armstrong D.A., Lesseur C., Conradt E. et al. DNA methylation across multiple tissues in early infancy: implications for children's health research. The FASEB Journal, 2014, vol. 28, no. 5, pp. 2088-2097 DOI: 10.1096/fj.13-238402
- Davies M. N., Volta M., Pidsley R. et al. Functional annotation of the human brain methylome identifies tissue-specific epigenetic variation across brain and blood. Genome Biology, 2012, 13(6):R43, pp. 2-14 DOI: 10.1186/gb-2012-13-6-r43
- Dempster E.L., Wong Chloe C.Y., Lester K.J. et al. Genome-wide Methylomic Analysis of Monozygotic Twins Discordant for Adolescent Depression. Biological Psychiatry, 2014, vol. 76, iss. 12. pp. 977-983 DOI: 10.1016/j.biopsych.2014.04.013
- Felger J.C., Lotrich F.E. Inflammatory cytokines in depression: Neurobiological mechanisms and therapeutic implications. Neuroscience, 2013, vol. 246, pp. 199-229 DOI: 10.1016/j.neuroscience.2013.04.060
- Hannona E., Lunnona K., Schalkwykb L., Millac J. Interindividual methylomic variation across blood, cortex, and cerebellum: implications for epigenetic studies of neurological and neuropsychiatric phenotypes. Epigenetics, 2015, vol. 10, iss. 11, pp. 1024-1032 DOI: 10.1080/15592294.2015.1100786
- Jiang R, Jones MJ, Chen E, et al. Discordance of DNA methylation variance between two accessible human tissues. Scientific Reports, Feb 2015. Article number: 8257 DOI: 10.1038/srep08257
- Lowe R, Gemma C., Beyan H. et al. Buccals are likely to be a more informative surrogate tissue than blood for epigenome-wide association studies. Epigenetics, 2013, vol. 8, iss. 4. pp. 445-454 DOI: 10.4161/epi.24362
- Oha G., Wangb Sun-Chong, Palb M. et al. DNA Modification Study of Major Depressive Disorder: Beyond Locus-by-Locus Comparisons. Biological Psychiatry, 2015. vol. 77, iss. 3, pp. 246-255. DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.biopsych.2014.06.016
- Petronis A. Epigenetics as a unifying principle in the aetiology of complex traits and diseases. Nature, 2010, vol. 465, pp. 721-727 DOI: 10.1038/nature09230
- Rakyan V.K., Down T.A., Balding D.J., Beck S. Epigenome-wide association studies for common human diseases. Nature Reviews Genetics, 2011. 12(8). pp. 529-541 DOI: 10.1038/nrg3000
- Smith A.K., Kilaru V., Klengel T. et al. DNA extracted from saliva for methylation studies of psychiatric traits: Evidence tissue specificity and relatedness to brain. American Journal of Medical Genetics Part B: Neuropsychiatric Genetics, 2015. vol. 168, iss. 1, pp. 36-44 DOI: 10.1002/ajmg.b.32278
- Thompson T.M., Sharfi D., Lee M. et al. Comparison of Whole-Genome DNA Methylation Patterns in Whole Blood, Saliva, and Lymphoblastoid Cell Lines. Behavior Genetics, 2013, vol. 43, pp. 168-176. DOI:10. 1007/s10519-012-9579-1
