Поиск ассоциаций полиморфных вариантов гена кислой хитиназы человека с бронхиальной астмой у детей г. Новосибирска
Автор: Макарова С.И., Митрофанов Д.В., Шинтяпина А.Б., Комова Е.Г., Зеленская В.В., Карцева Т.В., Кондюрина Е.Г., Вавилин В.А.
Журнал: Сибирский журнал клинической и экспериментальной медицины @cardiotomsk
Рубрика: Клинические исследования
Статья в выпуске: 4 т.36, 2021 года.
Бесплатный доступ
Высокая распространенность бронхиальной астмы (БА) среди населения (около 300 млн чел. во всем мире) делает актуальным поиск кандидатных генов заболевания. Кислая хитиназа человека (CHIA (AMCase)), кодируемая геном CHIA, участвует в деградации хитина, компонента клеточных стенок грибов и экзоскелета членистоногих, присутствие которых в пище или домашней пыли является провоцирующим фактором развития БА. Функционально значимые мутации в гене CHIA могут, по-видимому, усиливать риск подверженности БА.Цель исследования: оценка ассоциации однонуклеотидных замен (SNP) rs12033184 и rs3806448 в гене CHIA с БА у детей г. Новосибирска.Материал и методы. Исследование было организовано как «случай - контроль». В работе были использованы 537 образцов крови. SNP определяли методом ПЦР с детекцией в реальном времени. Ассоциацию полиморфных вариантов с заболеванием оценивали по отношению шансов (odds ratio - OR).Результаты. Не обнаружено ассоциации rs12033184 и rs3806448 с БА. Эти результаты приводят к выводу, что роль гена кислой хитиназы в развитии БА в популяции жителей г. Новосибирска менее существенна, чем в индийской популяции, где ранее была показана ее связь с заболеванием.
Ген кислой хитиназы человека, бронхиальная астма, rs12033184, rs3806448
Короткий адрес: https://sciup.org/149139373
IDR: 149139373 | DOI: 10.29001/2073-8552-2021-36-4-92-98
Список литературы Поиск ассоциаций полиморфных вариантов гена кислой хитиназы человека с бронхиальной астмой у детей г. Новосибирска
- Grayson M.H., Feldman S., Prince B.T., Patel P.J., Matsui E.C., Apter АЛ. А^апсеэ in asthma in 2017: Mechanisms, biologies, and genetics. J. Allergy Clin. Immunol. 2018;142(5):1423-1436. DOI: 10.1016/j. jaci.2018.08.033.
- García-Sánchez А., Isidoro-García M., García-Solaesa V., Sanz C., Hernández-Hernández L., Padrón-Morales J. et al. Genome-wide association studies (GWAS) and their importance in asthma. Aller-gol. Immunopathol. (Madr.). 2015;43(6):601-608. DOI: 10.1016/j.al-ler.2014.07.004.
- Ober C. Asthma genetics in the Post-GWAS Era. Ann. Am. Thorac. Soc. 2016;13(1):S85-S90. DOI: 10.1513/AnnalsATS.201507-459MG.
- Masaki K., Fukunaga K., Matsusaka M., Kabata H., Tanosaki T., Mochi-maru T. et al. Characteristics of severe asthma with fungal sensitization. Ann. Allergy Asthma Immunol .2017;119(3):253-257. DOI: 10.1016/j. anai.2017.07.008.
- Agache I., Lau S., Akdis C.A., Smolinska S., Bonini M., Cavkaytar O.J. et al. EAACI Guidelines on Allergen Immunotherapy: House dust mite-driven allergic asthma. Allergy. 2019;74(5):855-873. DOI: 10.1111/all.13749.
- dbSNP. CHIA. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/?term=CHIA
- Chatterjee R., Batra J., Das S., Sharma S.K., Ghosh B. Genetic association of acidic mammalian chitinase with atopic asthma and serum total IgE levels. J. Allergy Clin. Immunol. 2008;122 (1):202-208,208.e1-7. DOI: 10.1016/j.jaci.2008.04.030.
- Zhu Y., Yan X., Zhai C., Yang L., Li M. Association between risk of asthma and gene polymorphisms in CHI3L1 and CHIA: A systematic meta-analysis. BMC Pulm. Med. 2017;17(1):193. DOI: 10.1186/s12890-017-0515-2.
- Bierbaum S., Nickel R., Koch A., Lau S., Deichmann K.A., Wahn U. et al. Polymorphisms and haplotypes of acid mammalian chitinase are associated with bronchial asthma. Am. J. Respir. Crit. Care Med. 2005;172(12):1505-1509. DOI: 10.1164/rccm.200506-890OC.
- Wu A.C., Lasky-Su J., Rogers C.A., Klanderman B.J., Litonjua A. Polymorphisms of chitinases are not associated with asthma. J. Allergy Clin. Immunol. 2010;125(3):754-757,757.e1-757.e2. DOI: 10.1016/j. jaci.2009.12.995.
- Пузырев В.П., Кучер А.Н. Эволюционно-онтогенетические аспекты патогенетики хронических болезней человека. Генетика. 2011;47(12):1573-1585.
- Степанов В.А. Геномы, популяции, болезни: этническая геномика и персонифицированная медицина. Acta Naturae. 2010;2(4):18-34.
- dbSNP. rs3806448. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/rs3806448#-frequency_tab
- dbSNP. rs12033184. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/ rs12033184#frequency_tab
- Tjoelker L.W., Gosting L., Frey S., Hunter C.L., Trong H.L., Steiner B. et al. Structural and functional definition of the human chitinase chi-tin-binding domain. J. Biol. Chem. 2000;275(1):514-520. DOI: 10.1074/ jbc.275.1.514.
- Ober C., Chupp G.L. The chitinase and chitinase-like proteins: A review of genetic and functional studies in asthma and immune-mediated diseases. Curr. Opin. Allergy Clin. Immunol. 2009;9(5):401-408. DOI: 10.1097/ACI.0b013e3283306533.
- Van Eijk M., van Roomen C.P., Renkema G.H., Bussink A.P., Andrews L., Blommaart E.F. et al. Characterization of human phagocyte-derived chitotriosidase, a component of innate immunity. Int. Immunol. 2005;17(11):1505-1512. DOI: 10.1093/intimm/dxh328.
- Wu A.C., Lasky-Su J., Rogers C.A., Klanderman B.J., Litonjua A. Fungal exposure modulates the effect of polymorphisms of chitinases on emergency department visits and hospitalizations. Am. J. Respir. Crit. Care Med. 2010;182(7):884-889. DOI: 10.1164/rccm.201003-0322OC.
- Вавилин В.А., Макарова С.И., Ляхович В.В., Гавалов С.М. Ассоциация полиморфных генов ферментов биотрансформации ксенобиотиков с предрасположенностью к бронхиальной астме у детей с наследственной отягощенностью и без таковой. Генетика. 2002;38(4):539-545.
- Карунас А.С., Юнусбаев Б.Б., Федорова Ю.Ю., Гималова Г.Ф., Рама-занова Н.Н., Гурьева Л.Л. и др. Полногеномный анализ ассоциации бронхиальной астмы в Волго-Уральском регионе России. Молекулярная биология. 2011;45(6):992-1003.
