Молекулярно-генетический анализ верховки обыкновенной - Leucaspius delineatus (Heckel, 1843) из водоемов Республики Коми

Автор: Рафиков Р.Р., Шадрин Д.М., Пылина Я.И., Чадин И.Ф., Новоселов А.П.

Журнал: Известия Коми научного центра УрО РАН @izvestia-komisc

Статья в выпуске: 2 (22), 2015 года.

Бесплатный доступ

Проведено молекулярно-генетическое изучение верховки обыкновенной (Leucaspius delineatus (Heckel, 1843) бассейна р. Печора. Данные секвенирования участка мтДНК, кодирующего COI, свидетельствуют о едином механизме происхождения популяций данного вида на территории Республики Коми. AFLP анализ указывает на наличие генетической дифференциации исследованных образцов северо-восточной части ареала верховки обыкновенной. Коэффициент корреляции (0.5, p-value: 0.001) между матрицами генетических и географических расстояний популяций рыб также свидетельствует об их длительном обитании в бассейне р. Печора.

Верховка обыкновенная (leucaspius delineatus (heckel, бассейн р. печора, секвенирование гена coi мтднк, aflp анализ

Короткий адрес: https://sciup.org/14992749

IDR: 14992749

Список литературы Молекулярно-генетический анализ верховки обыкновенной - Leucaspius delineatus (Heckel, 1843) из водоемов Республики Коми

Берг Л.С. Рыбы пресных вод СССР и сопредельных стран. М.-Л.: Изд-во АН СССР, 1949. Т. 2. С. 469-925.
Зверева О.С., Кучина Е.С., Соловкина Л.Н. Рыбные богатства Коми АССР и пути их освоения. Сыктывкар: Коми книжн. изд-во, 1955. 106 с.
Атлас пресноводных рыб России: в 2 т. Т. 2/Под ред. Ю.С.Решетникова. М.: Наука, 2002. 253 с.
Рафиков Р.Р. Формирование рыбного населения искусственных водных объектов Республики Коми//Актуальные проблемы биологии и экологии: Материалы XIX Всероссийской молодежной науч. конференции (Сыктывкар, Республика Коми, Россия, 4-8 апреля 2012 г.). Сыктывкар, 2012. С. 94-96.
Бознак Э.И., Рафиков Р.Р. О находках уклейки (Alburnus alburnus) и верховки (Leucaspius delineatus) в водоемах бассейна р. Печора//Проблемы изучения и охраны животного мира на Севере: Материалы докладов Всероссийской науч. конференции с международ. участием (Сыктывкар, Республика Коми, Россия, 16-20 ноября 2009 г.). Сыктывкар, 2009. С. 34-35.
Интересова Е.А. Верховка Leucaspius delineatus (Cyprinidae) в водоемах юга Западной Сибири//Вопросы ихтиологии. 2012. Т. 52. № 3. С. 352-357.
Корляков К.А., Дубчак К.А. Продукционная и паразитологическая характеристика чужеродных короткоцикловых рыб водоемов восточного склона Южного Урала//Экология. 2010. № 4. С. 312-316.
Понкратов С.Ф. Инвазии чужеродных видов рыб в бассейн ангарских водохранилищ//Российский журнал биологических инвазий. 2013. № 4.
Попов П.А. Характеристика ихтиоценозов водохранилищ Сибири//География и природные ресурсы. 2012. № 3. С. 77-84.
Терещенко В.Г., Терещенко О.В. Трифонова Л.И. Формирование структуры рыбного населения водохранилища при интродукции новых видов рыб с первых лет его существования//Вопросы ихтиологии. 2004. Т. 44. №5. С. 619-631.
Ward R.D., Zemlak T.S., Innes B.H. еt аl. Barcoding Australia’s fish species//Philosophical Transactions of the Royal Society B 360. 2005. P. 1847-1857.
Tamura K., Stecher G., Peterson D., Filipski A., Kumar S. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0.//Molecular Biology and Evolution. 2013. № 30. P. 2725-2729.
R Core Team. R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing. Vienna, Austria, 2014.
Mantel N. The Detection of Disease Clustering and a Generalized Regression Approach//Cancer Research. 1967. Vol. 27. № 2. P. 209-220.
Pritchard J. K., Stephens M., Donnelly P. Inference of Population Structure Using Multilocus Genotype Data//Genetics. 2000. Vol. 155. № 2. P. 945-959.
Pritchard J.K., Wen W., Falush D. Documentation for STRUCTURE software: version 2.3. 2010. 38 p.
Evanno G., Regnaut S., Goudet J. Detecting the number of clusters of individuals using the software structure: a simulation study//Molecular Ecology. 2005. Vol. 14. № 8. P. 2611-2620.
Jakobsson M., Rosenberg N.A. CLUMPP: a cluster matching and permutation program for dealing with label switching and multimodality in analysis of population structure//Bioinformatics. 2007. Vol. 23. № 14. P. 1801-1806.
Rosenberg N.A. DISTRUCT: a program for the graphical display of population structure//Mol. Ecol. Notes. 2003. Vol. 4. № 1. P. 137-138.
Nei M. Molecular Evolutionary Genetics. New York: Columbia University Press, 1987.
GenBank Home. Электронный ресурс:(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/).
Вейр Б. С. Анализ генетических данных. М., 1995. 400 с.
Зверева О.С. Особенности биологии главных рек Коми АССР. Л.: Наука, 1969. 279 с.
Никольский Г.В. К истории ихтиофауны бассейна Белого моря//Зоологический журнал. 1943. Т. 22. №. 1. С. 27-32.
Zieba G., Copp, G.H., Davies, G.D. еt аl. Recent releases and dispersal of non-native fishes in England and Wales, with emphasis on sunbleak Leucaspius delineates//Aquatic Invasions. 2010. № 5. P. 155-161.
Алтухов Ю. П. Генетические процессы в популяциях. М.: Академкнига, 2003. 431 с.
Бознак Э.И., Захаров А.Б. Рыбное население индустриального водоема в условиях многофакторного антропогенного воздействия//Современные проблемы водохранилищ и их водосборов: в 2 т. Т.2: Управление водными ресурсами речных водосборов. Водная экология/Труды Междунар. научно-практ. конф. (26 мая -28 мая 2009 г., г.Пермь)/Перм. гос. ун-т. Пермь, 2009. С. 220 -224.
Рафиков Р. Р. Оценка экологического состояния водоема-охладителя Печорской ГРЭС по данным анализа флуктуирующей асимметрии//Проблемы изучения и охраны животного мира на Севере: Материалы докладов II Всероссийской науч. конференции с международ. участием (Сыктывкар, Республика Коми, Россия, 8-12 апреля 2013 г.). Сыктывкар, 2013. С. 177-179.
Рафиков Р. Р. Особенности рыбного населения индустриального водоема в бассейне р. Печора//Экологические проблемы северных регионов и пути их решения: Материалы докладов 5-й Всероссийск. науч. конференции с международ. участием (Апатиты, Мурманская область, Россия, 24-27 июня 2014 г.). Апатиты, 2014. С. 212-215.

Еще

Статья научная