Методика определения разброса температур по лункам анализаторов нуклеиновых кислот
Автор: Белов Дмитрий Анатольевич, Альдекеева А.C., Белов Ю.В., Киселев И.Г.
Журнал: Научное приборостроение @nauchnoe-priborostroenie
Рубрика: Системный анализ приборов и измерительных методик
Статья в выпуске: 4 т.27, 2017 года.
Бесплатный доступ
В работе предложена усовершенствованная методика определения разброса температур по лункам на основе нелинейной аппроксимации сигмоидальной функцией (СФ) сигналов флуоресценции при плавлении ДНК. Использованы флуоресцентные зонды с высокой температурной зависимостью (порядка 15 % К-1). Результаты представлены в табличном и графическом виде. Показано, что температура плавления ДНК во всех пробирках и их среднее значение соответствуют абсолютной шкале температуры в °С. Получены следующие результаты: разброс температур не более ±0.2 °С, среднее значение температур плавления ДНК всех пробирок равно T mс = 80.82 °С. Максимальное отклонение температуры по 6 группам по 16 пробирок (4 × 4) от среднего значения составляет 0.15 °С и не превосходит предельно допустимых значений ±0.2 °С. Предложено использовать полученные результаты для выравнивания каналов управления элементов Пельтье, настройки, калибровки и проверки тепловых параметров анализаторов нуклеиновых кислот.
Пцр в реальном времени, методика плавления днк, сигмоидальная функция
Короткий адрес: https://sciup.org/142214831
IDR: 142214831 | DOI: 10.18358/np-27-4-i3439
Список литературы Методика определения разброса температур по лункам анализаторов нуклеиновых кислот
- Веденов А.А., Дыхне А.М., Франк-Каменецкий М.Д. Переход спираль-клубок в ДНК//Успехи физических наук. 1971. Т. 105, № 11. С. 479-519 DOI: 10.3367/UFNr.0105.197111d.0479
- ДНК плавление. URL: http://humbio.ru/humbio/dnastructure/0002a247.htm.
- Алексеев Я.И., Белов Ю.В., Варламов Д.А. и др. Приборы для диагностики биологических объектов на основе метода полимеразной цепной реакции в реальном времени (ПЦР-РВ)//Научное приборостроение. 2006. Т. 16, № 3. С. 132-136. URL: http://213.170.69.26/mag/2006/abst3.php#abst15.
- Воробьев Д.В. Анализ и реализация методов измерения температуры//Теория и практика имитационного моделирования и создания тренажeров. Сборник статей Международной научно-практической конференции, г. Пенза, 14-15 декабря 2016 г. С. 42-47.
- Беленький А.М. Измерение температуры: теория, практика, эксперимент. Т. 2. Справочное издание в 3 томах. Москва: Теплотехник, 2007. 736 с.
- Битюков В.К., Петров В.А. Методы и средства бесконтактного контроля теплового состояния изделий. Учебное пособие. Московский государственный институт радиотехники, электроники и автоматики (технический университет). М., 1999. 94 с.
- Жорина Л.В. Методы неинвазивного измерения внутренней температуры тела//Вестник Тамбовского университета. Серия: Естественные и технические науки. Тамбов, 2017. Т. 22, вып. 2. С. 464-470 DOI: 10.20310/1810-0198-2017-22-2-464-470
- Chamarthy P., Garimella S.V., Wereley S.T. Measurement of the temperature non-uniformity in a microchannel heat sink using microscale laser-induced fluorescence//International Journal of Heat and Mass Transfer. 2010. Vol. 53, no. 15-16. P. 3275-3283. Doi: 10.1016/j.ijheatmasstransfer.2010.02.052.
- Варламов Д.А., Герасимов М.А., Савина Ж.А., Сочивко Д.Г., Федоров А.А. Неинвазивный анализ тепловых процессов в реакторах приборов для проведения полимеразной цепной реакции в реальном времени//Материалы конференции "Информационно-технологический и телекоммуникационный кластер наукограда Черноголовка: продукция, партнерство и перспективы развития". Черноголовка, "Богородский печатник", 2015. С. 55-57.
- Сочивко Д.Г., Варламов Д.А., Федоров А.А., Курочкин В.Е. Метод бесконтактного измерения температуры в реакторах полимеразной цепной реакции//Письма в ЖТФ. 2016. Т. 42, вып. 7. С. 53-58.
- Natrajan V.K., Christensen K.T. Development of fluorescent thermometry methods for microfluidic systems//14th Int Symp on Applications of Laser Techniques to Fluid Mechanics. Lisbon, Portugal, 07-10 July, 2008.
- ИАП РАН. Устройство для обнаружения специфической последовательности нуклеиновых кислот "АНК". Руководство по эксплуатации ПКДН.941417.003 РЭ, 2013.
- Thermo Fisher Scientific: Real-Time PCR (qPCR). URL: http://www.lifetechnologies.com/ru/ru/home/life-science/pcr/real-time-pcr.html.
- Белов Д.А., Корнева Н.А., Альдекеева А.C., Белов Ю.В., Киселев И.Г. Повышение разрешающей способности генетических анализаторов при определении температуры плавления ДНК//Научное приборостроение. 2016. Т. 26, № 2. С. 17-22. URL: http://213.170.69.26/mag/2016/abst2.php#abst2.
