Компьютерные средства анализа транскриптомных данных: программный комплекc ExpGene
Автор: Спицина Анастасия Михайловна, Брагин Анатолий Олегович, Дергилев Артур Игоревич, Чадаева Ирина Витальевна, Твердохлеб Наталья Николаевна, Галиева Эльвира Расимовна, Табиханова Людмила Эдмундовна, Орлов Юрий Львович
Журнал: Программные системы: теория и приложения @programmnye-sistemy
Рубрика: Программное и аппаратное обеспечение распределенных и суперкомпьютерных систем
Статья в выпуске: 2 (33) т.8, 2017 года.
Бесплатный доступ
Технологии высокопроизводительного секвенирования ДНК позволяют получать данные экспрессии генов в масштабе генома, как на микрочипах, так и на основе транскриптомного профилирования. Необходимо развитие новых компьютерных методов анализа таких данных, опирающихся на суперкомпьютерные технологии. Рассмотрены задачи анализа транскриптом в контексте вычислительной сложности. Представлены примеры применения программного комплекса ExpGene для статистической обработки и визуализации транскриптомных и микрочиповых данных. Показаны приложения для анализа транскриптом отделов мозга лабораторных животных
ID: 14336120 Короткий адрес: https://sciup.org/14336120
