Экспрессия интронной микроРНК MIR-153 при раке предстательной железы

Экспрессия интронной микроРНК MIR-153 при раке предстательной железы

Автор: Долотказин Данияр Рустамович, Шкурников М.Ю., Стаканов В.А., Алексеев Б.Я.

Журнал: Экспериментальная и клиническая урология @ecuro

Рубрика: Онкоурология

Статья в выпуске: 4 т.14, 2021 года.

Бесплатный доступ

Введение. Поиск новых маркеров ранней диагностики рака предстательной железы (РПЖ) является актуальной задачей. Наиболее перспективным субстратом для изучения являются микроРНК. Материалы и методы. Исследование построено на результатах биоинформационного анализа результатов секвенирования мРНК и микроРНК 184 образцов РПЖ и 50 образцов условно здоровой ткани предстательной железы. Результаты. Среди 182 дифференциально представленных при Т2х РПЖ выявлено четыре гена-хозяина пре-микроРНК: AMH (hsa-mir-4321), MYH6 (hsa-mir-208), MYH7 (hsa-mir-208b), PTPRN (hsa-mir-153-1). Только экспрессия hsa-miR-153-3p значимо различалась между группами сравнения. Выявлено девять факторов транскрипции, способных регулировать экспрессию данной микроРНК: AR, CREB1, CTCF, ERG, ETV1, GABPA, MYC, SUMO2, TRIM24. Последующий анализ коэкспрессии показал значимую положительную корреляцию экспрессии hsa-miR-153-3p с андрогеновым рецептором. Заключение. МикроРНК miR-153 может рассматриваться как перспективный маркер ранних стадий РПЖ. Представляется важным изучение уровня miR-153 не только в биопсийном материале, но и в плазме крови, моче при РПЖ и гиперплазии.

Еще

Рак предстательной железы, диагностика, интроннаямикрорнк, mir-153, секвенирование

Короткий адрес: https://sciup.org/142231530

IDR: 142231530   |   DOI: 10.29188/2222-8543-2021-14-4-44-48

Список литературы Экспрессия интронной микроРНК MIR-153 при раке предстательной железы

  • Злокачественные новообразования в России в 2018 году (заболеваемость и смертность); под. ред. Каприна А.Д., Старинского В.В., Петровой Г.В. Москва 2019; 250 с. [Malignant neoplasms in Russia in 2018 (morbidity and mortality); Ed. Kaprin A.D., Starinskiy V.V., Petrova G.V. Moscow, 2019; 250 s. (in Russian)].
  • Woolf SH. The accuracy and effectiveness of routine population screening with mammography, prostate-specific antigen, and prenatal ultrasound: a review of published scientific evidence. Int J Technol Assess Health Care 2001;17(3): 275–304. https://doi.org/10.1017/s0266462301106021.
  • Schröder FH, van der Maas P, Beemsterboer P, Kruger AB, Hoedemaeker R, Rietbergen J, et al. Evaluation of the digital rectal examination as a screening test for prostate cancer. Rotterdam section of the European Randomized Study of Screening for Prostate Cancer. J Natl Cancer Inst 1998;90(23):1817–1823.
  • Bhavsar T, McCue P, Birbe R. Molecular diagnosis of prostate cancer: are we up to age? Semin Oncol 2013;40(3):259–275. https://doi.org/10.1053/ j.seminoncol.2013.04.002.
  • Raja N, Russell CM, George AK. Urinary markers aiding in the detection and risk stratification of prostate cance. Transl Androl Urol 2018;7(S4):S436–S442. https://doi.org/10.21037/tau.2018.07.01.
  • Makarova JA, Shkurnikov MU, Wicklein D, Lange T, Samatov TR, Turchinovich AA, et al. Intracellular and extracellular microRNA: An update on localization and biological role. Prog Histochem Cytochem 2016; 51(3-4):33–49. https://doi.org/10.1016/j.proghi.2016.06.001.
  • Makarova JA, Shkurnikov MU, Turchinovich AA, Tonevitsky AG, Grigoriev AI. Circulating microRNAs. Biochem 2015;80(9):1117–1126. https://doi.org/10.1134/S0006297915090035.
  • Salido-Guadarrama AI, Morales-Montor JG, Rangel-Escareño C, Langley E, Peralta-Zaragoza O, Cruz Colin JL., et al. Urinary microRNA-based signature improves accuracy of detection of clinically relevant prostate cancer within the prostate-specific antigen grey zone. Mol Med Rep 2016;13(6):4549-4560. https://doi.org/10.3892/mmr.2016.5095.
  • Korzeniewski N, Tosev G, Pahernik S, Hadaschik B, Hohenfellner M, Duensing S. Identification of cell-free microRNAs in the urine of patients with prostate cancer. Urol Oncol 2015;33(1):16.e17-16.e22. https://doi.org/10.1016/ j.urolonc.2014.09.015.
  • Casanova-Salas I, Rubio-Briones J, Calatrava A, Mancarella C, Masiá E, Casanova J, et al. Identification of miR-187 and miR-182 as biomarkers of early diagnosis and prognosis in patients with prostate cancer treated with radical prostatectomy. J Urol 2014;192(1):252-259. https://doi.org/10.1016/ j.juro.2014.01.107.
  • Yun SJ, Jeong P, Kang HW, Kim Y-H, Kim E-A, Yan C, et al. Urinary MicroRNAs of prostate cancer: virus-encoded hsv1-miRH18 and hsv2-miR-H9-5p could be valuable diagnostic markers. Int Neurourol J 2015;19(2):74-84. https://doi.org/10.5213/inj.2015.19.2.74.
  • Stuopelyte K, Daniunaite K, Bakavicius A, Lazutka JR, Jankevicius F, Jarmalaite S. The utility of urine-circulating miRNAs for detection of prostate cancer. Br J Cancer 2016;115(6):707–715. https://doi.org/10.1038/bjc.2016.233.
  • Bryant RJ, Pawlowski T, Catto JWF, Marsden G, Vessella RL, Rhees B, et al. Changes in circulating microRNA levels associated with prostate cancer. Br J Cancer 2012;106(4):768–774. https://doi.org/10.1038/bjc.2011.595.
  • Love MI, Huber W, Anders S. Moderated estimation of fold change and dispersion for RNA-seq data with DESeq2. Genome Biol 2014;15(12):550. https://doi.org/10.1186/s13059-014-0550-8.
  • Korotkevich G, Sukhov V, Budin N, Shpak B, Artyomov M, Sergushichev A. Fast gene set enrichment analysis. bioRxiv. Cold Spring Harbor Laboratory 2016; P. 060012. https://doi.org/10.1101/060012.
  • Liberzon A, Birger C, Thorvaldsdóttir H, Ghandi M, Mesirov JP, Tamayo P. The Molecular Signatures Database Hallmark Gene Set Collection. Cell Syst 2015;1(6):417–425. https://doi.org/10.1016/j.cels.2015.12.004.
  • Subramanian A, Tamayo P, Mootha VK, Mukherjee S, Ebert BL, Gillette MA, et al. Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proc Natl Acad Sci 2005;102(43):15545–15550. https://doi.org/10.1073/pnas.0506580102.
  • Tong Z, Cui Q, Wang J, Zhou Y TransmiR v2.0: an updated transcription factor-microRNA regulation database. Nucleic Acids Res 2019;47(D1):D253–D258. https://doi.org/10.1093/nar/gky1023.
  • Vilamaior PSL., Taboga SR, Carvalho HF. Modulation of smooth muscle cell function: morphological evidence for a contractile to synthetic transition in the rat ventral prostate after castration. Cell Biol Int 2005;29(9):809–816. https://doi.org/10.1016/j.cellbi.2005.05.006.
  • Uo T, Plymate SR, Sprenger CC. The potential of AR-V7 as a therapeutic target. Expert Opin Ther Targets 2018;22(3):201-216. https://doi.org/10.1080/14728222.2018.1439016.
  • Lan MS. Assignment of the IA-2 gene encoding an autoantigen in IDDM to chromosome 2q35. Diabetologia 1996;39(8):1001-1002. https://doi.org/10.1007/ BF00403923.
  • Zhangyuan G, Yin Y, Zhang W, Yu W, Jin K, Wang F, et al. Prognostic value of phosphotyrosine phosphatases in hepatocellular carcinoma. Cell Physiol Biochem 2018;46(6):2335-2346. https://doi.org/10.1159/000489625.
  • Bauerschlag DO, Ammerpohl O, Bräutigam K, Schem C, Lin Q, Weigel MT, et al. Progression-free survival in ovarian cancer is reflected in epigenetic DNA methylation profiles. Oncology 2011;80(1-2):12-20. https://doi.org/10.1159/000327746.
  • Shergalis A, Bankhead A, Luesakul U, Muangsin N, Neamati N. Current challenges and opportunities in treating glioblastoma. Pharmacol Rev 2018;70(3):412–445. https://doi.org/10.1124/pr.117.014944.
  • Wu Z, He B, He J, Mao X. Upregulation of miR-153 promotes cell proliferation via downregulation of the PTEN tumor suppressor gene in human prostate cancer. Prostate 2013;73(6):596-604. https://doi.org/10.1002/pros.22600.
  • Bi C, Zhang G, Bai Y, Zhao B, Yang H. Increased expression of miR-153 predicts poor prognosis for patients with prostate cancer. Medicine (Baltimore) 2019;98(36):e16705. https://doi.org/10.1097/MD.0000000000016705.
Еще
Статья научная
SciUp 2024 © 2024 ©