Использование секвенирования следующего поколения (NGS) для диагностики пациентов с миелоидными новообразованиями

Автор: Булдаков И. А., Полушкина Л. Б., Шуваев В. А., Самородова А. П., Фоминых М. С., Бессмелъцев С. С., Чечеткин А. В., Волошин С. В., Мартынкевич И. С.

Журнал: Вестник гематологии @bulletin-of-hematology

Рубрика: Оригинальные статьи

Статья в выпуске: 1 т.16, 2020 года.

Бесплатный доступ

Стремительное развитие технологии NGS существенно расширило рамки представлений о патогенезе миелоидных новообразований. Помимо стандартных цитогенетических и молекулярно-генетических исследований метод NGS все чаще входит в рутинную практику при диагностике миелоидных новообразований, при прогнозировании течения заболевания, а также при выборе таргетной терапии. В данной работе в рамках рутинной лабораторной практики были проанализированы результаты NGS исследования панели генов у 21 пациента с различными типами и фазами миелоидных новообразований.У каждого пациента было показано наличиетех или иных генетических аберраций, количество которых варьировало от 4 до 12. У 6из 9 пациентов с обнаруженными 2 и болееклинически значимыми мутациями в анамнезе наблюдалась бластная трансформация. У пациентов с драйверными мутациями бластной трансформации сопутствовали дополнительные мутации в генах, ответственных за эпигенетическую регуляцию, а у тринегативных пациентов по драйверным мутациям - в генах,ответственных за передачу сигнала. Результатысеквенирования панели генов методом NGS позволяют не только достоверно установитьдиагноз, определить прогностические особенности течения заболевания, но и, благодаря накоплению и систематизации данных, обнаружению новых мутаций, способствуют болееглубокому пониманию патогенеза миелоидных новообразований.

Еще

Миелопролиферативные новообразования, секвенирование следующего поколения, мутации, прогноз

Короткий адрес: https://sciup.org/170172538

IDR: 170172538

Список литературы Использование секвенирования следующего поколения (NGS) для диагностики пациентов с миелоидными новообразованиями

  • Bacher U., Shumilov E., Flach J., Porret N., Joncourt R., Wiedemann G., Fiedler M., Novak U., Amstutz U., Pabst T. Challenges in the introduction of next-generation sequencing (NGS) for diagnostics of myeloid malignancies into clinical routine use. // Blood Cancer J. 2018.— Vol. 8.— № 8.— P. 113.
  • Maes B., Willemse J., Broekmans A. et al. Targeted next-generation sequencing using a multigene panel in myeloid neoplasms: Implementation in clinical diagnostics.//Int J Lab Hem. 2017. — Vol. 39.— № 39.— P. 604-612.
  • Tefferi A., Lasho T. L., Patnaik M. M. et al. Targeted next-generation sequencing in myelodysplastic syndromes and prognostic interaction between mutations and IPSS-R. //Am J Hematology.— 2017.—Vol. 92.— № 92.— P. 1311-1317.
  • Tefferi A., Gangat N., Mudireddy M. et al. Mayo Alliance Prognostic Model for Myelodysplastic Syndromes: Integration of Genetic and Clinical Information. // Mayo Clin Proc.— 2018.—Vol. 93.— №1.— Р. 1363-1374.
  • Marneth A. E., Mullally A. The molecular genetics of myeloproliferative neoplasms. // Cold Spring Harb Perspect Med.— 2020.— Vol. 10.— № 10.— Р. 183-197.
  • Arber D.A., Orazi A., Hasserjian R., et al. The 2016 revision of the World Health Organization classification of myeloid neoplasms and acute leukemia.//Blood.— 2016.— Vol. 127.— № 127.— Р. 2391-2405.
  • Vannucchi A., Guglielmelli P., Rotunno G., et al. Mutation-enhanced international prognostic scoring system (MIPSS) for primary myelofibrosis: an AGIMM&IWG-MRT project.//Blood.— 2014.— Vol. 124.— № 124.— Р. 405.
  • Boddu P. C., Kadia T. M., Garcia-Manero G., Cortes J., Alfayez M., Borthakur G., Konopleva M., Jabbour E. J., Daver N. G., DiNardo C. D., Naqvi K., Yilmaz M., Short N. J., Pierce S., Kantarjian H. M., Ravandi F. C. Validation of the 2017 European LeukemiaNet classification for acute myeloid leukemia with NPM1 and FLT3-internal tandem duplication genotypes. //Cancer.— 2019.— Vol. 125.— № 125.— Р. 1091-1100.
  • Palumbo G. A., Stella S., Pennisi M. S., Pirosa C., Fermo E., Fabris S., Cattaneo D., Iurlo A. The Role of New Technologies in Myeloproliferative Neoplasms.//Front Oncol.— 2019.— Vol. 9.— № 9.— Р. 321.
  • Carbonell D., Suárez- González J., Chicano M., Andrés- Zayas C., Triviño J. C., Rodríguez-Macías G., Bastos-Oreiro M., Font P., Ballesteros M., Muñiz P., Balsalobre P., Kwon M., Anguita J., Díez-Martín J. L., Buño I., Martínez-Laperche C. Next-Generation Sequencing Improves Diagnosis, Prognosis and Clinical Management of Myeloid Neoplasms //Cancers (Basel).— 2019.— Vol. 11.— № 11.— Р. 1364.
  • Venton G., Courtier F., Charbonnier A., D'incan E., Saillard C., Mohty B., Mozziconacci M. J., Birnbaum D., Murati A., Vey N., Rey J. Impact of gene mutations on treatment response and prognosis of acute myeloid leukemia secondary to myeloproliferative neoplasms. // Am J Hematol.— 2018.— Vol. 93.— №93.— Р. 330-338.
  • Aguilera-Diaz A., Vazquez I., Ariceta B., Mañú A., Blasco-Iturri Z., Palomino- Echeverría S., Larrayoz M. J., García-Sanz R., Prieto-Conde M. I., Del Carmen Chillón M., Alfonso- Pierola A., Prosper F., Fernandez-Mercado M., Calasanz M. J. Assessment of the clinical utility of four NGS panels in myeloid malignancies. Suggestions for NGS panel choice or design. // PLoS One.— 2020.— Vol. 15.— № 15.
  • Lundberg P., Karow A., Nienhold R., Looser R., Hao-Shen H., Nissen I., Girsberger S., Lehmann T., Passweg J., Stern M., Beisel C., Kralovics R., Skoda R. C. Clonal evolution and clinical correlates of somatic mutations in myeloproliferative neoplasms.//Blood.— 2014.— Vol. 123.— № 123.— Р. 2220-2228.
  • Jon Akutagawa, Tannie Q. Huang, Inbal Epstein, Tiffany Chang, Maricel Quirindongo-Crespo, Charisa L. Cottonham, Monique Dail, Barbara S. Slusher, Lori S. Friedman, Deepak Sampath, and Benjamin S. Braun. Targeting the PI3K / Akt pathway in murine MDS / MPN driven by hyperactive Ras. // Leukemia.— 2016.— Vol. 30.— № 30.— Р. 1335-1343.
  • Tiffany Chang, Kimberly Krisman, Emily Harding Theobald, Jin Xu, Jon Akutagawa, Jennifer O. Lauchle, Scott Kogan, Benjamin S. Braun, and Kevin Shannon. Sustained MEK inhibition abrogates myeloproliferative disease in Nf1 mutant mice.//J Clin Invest.— 2013. — Vol. 123.— № 123.— Р. 335-339.
Еще
Статья научная