Полиморфизм межмикросателлитных повторов у видов лука

Автор: Домблидес А.С., Домблидес Е.А., Кан Л.Ю., Романов В.С.

Журнал: Овощи России @vegetables

Рубрика: Теория и практика селекции овощных культур

Статья в выпуске: 3 (12), 2011 года.

Бесплатный доступ

В исследование были взяты следующие виды лука: A. altaicum, A. odorum, A. fistulosum, A. nutans, A. schoenoprasum, A. altissimum, A.proliferum, A. tuberosum, A. subhirsutum, A.roylei, A.auctum, A.rupestre, A.vavilovii, ДНК которых была использована для проведения ISSR анализа. Формы, полученные в результате межвидовых скрещиваний: A.cepa x A.nutans и А.сера x A. fistulosum, были в дальнейшем оценены с помощью ДНК маркеров. 5 ISSR праймеров были отобраны из 15 проверенных и использованы для анализа. В итоге было выявлено 76 % полиморфизма у исследуемых образцов. Образцы, полученные в результате гибридизации между видами A. nutans и A. cepa, расположились в дендрограмме ближе к кластеру A. cepa, тогда как вид A. nutans располагался дальше от A.cepa с индексом схожести 0,52 и с индексом 0,49 от гибридных образцов. Виды A. fistulosum и А. altaicum, так же, как и виды A.altissimum и A.schoenoprasum схожи по ISSR спектрам, что не расходится с результатами предыдущих филогенетических исследований.

Еще

Issr маркеры, виды лука, полиморфизм

Короткий адрес: https://readera.org/14024896

IDR: 14024896

Список литературы Полиморфизм межмикросателлитных повторов у видов лука

  • Dellaporta, S.L., Wood, J., Hicks, J.B. A plant DNA minipreparation: Version II. Plant Mol. Biol. Rep. 1983. 1(4). P. 19 -21
  • R. Waugh. RAPD Analysis: use for genome characterization, tagging traits and mapping//Plant Molecular Biology -A Laboratory Manual/Ed by Melody S., Clark. Berlin. Heidelberg: Springer-Verlag, 1997.-P. 305-333.
  • Tanikawa T., Takagi M., Ichiim (2002) Cultivar identification and genetic diversity in onion (Allium cepa L.) as evaluated by random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis. J Jpn Soc Hort Sci 71:249-251
  • Shigyo M., Miyazaki.T, Isshiki S., Tashiro Y. (1997a) Assignment of randomly amplified polymorphic DNA markers to all chromosomes of shallot (Allium cepa L. Aggregatum group). Genes Genet Syst 72:249-252
  • Stack S.M., Comings D.E. (1979) The chromosomes and DNA of Allium cepa. Chromosoma 70:161-181
  • A.W. Van Heusden J.W. van Ooijen R. Vrielink-van Ginkel W.H.J. Verbeek W.A. Wietsma C. Kik A genetic map of an interspecific cross in Allium based on amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers. Theor Appl Genet (2000) 100:118-126
  • L.W.D. Raamsdonk, W. Ensink, A.W. Heusden, M. Vrielink-van Ginkel and C. Kik Biodiversity assessment based on cpDNA and crossability analysis in selected species of Allium subgenus Rhizirideum//Theor Appl Genet (2003) 107:1048-1058
  • Zietkiewicz E., Rafalski A., and Damian Labuda D. Genome fingerprinting by simple sequence repeats (SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification.//Genomics 1994, 20. P. 176-183
  • Klaas, M., N. Friesen 2002. Molecular markers in Allium, p 159-186 In: Rabinowitch, H.D. and L. Currah (eds.). Allium crop science: Recent advances CABI Publishing, New York, NY
Еще
Статья научная