Численное моделирование эволюции бактериальной популяции в легких человека

Бесплатный доступ

Представлена математическая модель эволюции бактериальной популяции в легких человека с учетом динамики иммунных процессов для задачи оценки функционального повреждения легких. Численное моделирование процессов, происходящих в организме человека, рассматривается как один из инструментов для анализа и прогнозирования влияния факторов риска на здоровье. Представленный подход выполнен в рамках концепции многоуровневой модели организма человека, учитывающей взаимодействия между системами, а также функциональное состояние включенных в рассмотрение органов в условиях воздействия на них неблагоприятных факторов различного генеза. Ввиду сложности прямого моделирования структуры и процессов, происходящих в легких, из-за больших вычислительных ресурсов для описания последних используется модель пористой среды. В модель введена поврежденность легких, определяемая эволюционным уравнением. Уравнение описывает зависимость поврежденности от распределения инфильтрата и действия на клетки альвеол токсических веществ, выделяемых бактериями. Представлены некоторые результаты, характеризующие пространственное распределение концентраций компонентов иммунной системы и бактериальной популяции в ходе иммунного ответа. Проведенное исследование дает качественное представление о причинах количественного изменения бактериальной популяции при иммунной реакции организма в условиях воздействия различных факторов. Данный подход может быть использован для уточнения параметров существующих популяционных моделей распространения и течения бактериальных инфекций и построения долгосрочного прогноза эпидемиологической ситуации. Получаемые результаты могут быть полезны для проведения анализа риска инфекционных заболеваний, в том числе при воздействии на организм человека неблагоприятных факторов среды обитания.

Еще

Математическое моделирование, иммунный ответ, бактериальная популяция, выделение токсинов, функциональная поврежденность, легкие человека, пористая среда, течение многокомпонентной смеси

Короткий адрес: https://sciup.org/142229573

IDR: 142229573   |   DOI: 10.21668/health.risk/2021.1.02

Список литературы Численное моделирование эволюции бактериальной популяции в легких человека

  • Гребенев А.Л. Пропедевтика внутренних болезней. - М.: Медицина, 2001. - 592 с.
  • Шкляр Б.С. Диагностика внутренних болезней. - Киев: Высшая школа, 1972. - 516 с.
  • Математическая модель эволюции функциональных нарушений в организме человека с учетом внешне средо-вых факторов / П.В. Трусов, Н.В. Зайцева, Д.А. Кирьянов, М.Р. Камалтдинов, М.Ю. Цинкер, В.М. Чигвинцев, Д.В. Ла-нин // Математическая биология и биоинформатика. - 2012. - Т. 7, № 2. -С. 589-610.
  • К оценке дополнительного риска заболеваний желудочно-кишечного тракта, ассоциированных с дисбиозом кишечной микрофлоры вследствие воздействия остаточных концентраций тетрациклина в пищевых продуктах / Н.В. Зайцева, П.З. Шур, А.И. Аминова, Д.А. Кирьянов // Здоровье населения и среда обитания. - 2012. - Т. 232, № 7. - С. 46-48.
  • Регуляция противовирусного иммунного ответа организма: математическая модель, качественный анализ, результаты / П.В. Трусов, Н.В. Зайцева, В.М. Чигвинцев, Д.В. Ланин // Математическая биология и биоинформатика. -2018. - Т. 13, № 2. - С. 402-425.
  • Трусов П.В., Зайцева Н.В., Цинкер М.Ю. О моделировании течения воздуха в легких человека: конститутивные соотношения для описания деформирования пористой среды // Вестник Пермского национального исследовательского политехнического университета. Механика. - 2020. - № 4. - С. 165-174.
  • Monod J. The growth of bacterial cultures // Annual Review of Microbiology. - 1949. - Vol. 3. - P. 371-394. DOI: 10.1146/annurev.mi.03.100149.002103
  • Limit cycles of Norwegian lemmings: tensions between phase-dependence and density-dependence / E. Framstad, N.C. Sten-seth, O.N. Bjornstad, W. Falck // Phil. Trans. R. Soc. Lond. B. - 1997. - Vol. 264, № 1378. - P. 31-38. DOI: 10.1098/rspb.1997.0005
  • Бутов А.А., Егоров А.Г. Модель динамики численности однотипной популяции в пространстве и времени // Вестник Кемеровского государственного университета. - 2015. - Т. 64, № 4-3. - С. 121-127.
  • Hong M., Xiaojuan Z. Microbial growth modeling and simulation based on cellular automata // Research Journal of Applied Sciences, Engineering and Technology. - 2013. - Vol. 6, № 11. - P. 2061-2066. DOI: 10.19026/RJASET.6.3824
  • Modeling evolution of spatially distributed bacterial communities: a simulation with the haploid evolutionary constructor / A.E. Klimenko, Y.G. Matushkin, N.A. Kolchanov, S.A. Lashin // BMC Evolutionary Biology. - 2015. - Vol. 15, № 1. - P. 1-11. DOI: 10.1186/1471-2148-15-S1-S3
  • 3D individual based for bacteria growth and spatial interactions: application to the case of Listeria Monocytogenes and Carnobacterium Piscola / F. Harrouet, G. Desmeulles, P. Redou, L. Guabert // Jan Van Impe. Food Sim. - 2016. - P. 6.
  • Гинак А.И., Кузнецова С.Н., Милованович Е.В. Моделирование биохимических процессов в призабойной зоне скважины // Известия Санкт-Петербургского государственного технологического института. - 2012. - Т. 41, № 15. -С. 82-83.
  • Холодонов В.А., Лукина М.В., Милованович Е.В. Моделирование биотехнологических и фильтрационных процессов повышения нефтеотдачи пластов // Известия Санкт-Петербургского государственного технологического института. - 2011. - Т. 37, № 11. - С. 69-71.
  • Марчук Г.И. Математические модели в иммунологии. Вычислительные методы и эксперименты. - М.: Наука, 1991. - 304 с.
  • Левченко О.Ю. Математическое моделирование противобактериального иммунного ответа // Политематический сетевой электронный научный журнал кубанского государственного аграрного университета. - 2011. - № 66. -С. 60-71.
  • Smith A.M., McCullers J.A., Adler F.R. Mathematical model of a three-stage innate immune response to a pneumococcal lung infection // Journal of Theoretical Biology. - 2011. - Vol. 7, № 276 (1). - P. 106-116. DOI: 10.1016/j.jtbi.2011.01.052
  • Кузнецов С.Р. Математическая модель иммунного ответа // Вестник Санкт-Петербургского университета. Прикладная математика. Информатика. Процессы управления. - 2015. - № 4. - С. 72-87.
  • Lambert A.R. Regional deposition of particles in an imagebased airway model: CFD simulation and left-right lung ventilation asymmetry. - Iowa: University of Iowa, 2010. - P. 68.
  • De Groot C.T., Straatman A.G. A conjugate fluid-porous approach for simulating airflow in realistic geometric representations of the human respiratory system // Journal of Biomechanical Engineering. - 2016. - Vol. 138, № 3. - P. 4032113. DOI: 10.1115/1.4032113
  • DeGroot C.T., Straatman A.G. Towards a porous media model of the human lung // 4th International Conference on Porous Media and its Applications in Science: AIP Conference Proceedings. - 2012. - Vol. 1453, № 1. - P. 69-74. DOI: 10.1063/1.4711155
  • Вейбель Э.Р. Морфометрия легких человека. - М.: Медицина, 1970. - 175 с.
  • Weibel E.R. What makes a good lung? // Swiss Med. Wkly. - 2009. - Vol. 139, № 27-28. - P. 375-386.
Еще
Статья научная