Бактериальные профили и фенотипические биомаркеры изолятов микробиоты среды обитания: факторы идентификации опасности

Автор: Дудчик Н.В., Сычик С.И., Нежвинская О.Е., Коломиец Н.Д., Федоренко Е.В., Дроздова Е.В., Тонко О.В., Емельянова О.А.

Журнал: Анализ риска здоровью @journal-fcrisk

Рубрика: Оценка риска в эпидемиологии

Статья в выпуске: 2 (30), 2020 года.

Бесплатный доступ

Произведена оценка бактериальных профилей микробиоты технологического оборудования пищевых производств, объектов лечебно-профилактических учреждений и водных объектов в зонах рекреации, исследование фенотипических признаков изолятов условно-патогенных бактерий как факторов идентификации опасности в рамках концепции оценки риска. Объектом исследования послужили штаммы родов Escherichia, Klebsiella, Enterobacter, Staphylococcus, Pseudomonas, Citrobacter и Serratia, выделенные во время гигиенического мониторинга с 2013 по 2017 г. Для взятия проб использовали методы смывов, прямого посева, мембранной фильтрации, инструментальный аспирационный метод. Микробный статус анализировали культуральными и биохимическими методами на питательных и дифференциально-диагностических средах с последующим подтверждением методом полимеразной цепной реакции (ПЦР). Фенотипические особенности изучали in vitro стандартными биохимическими и микробиологическими методами в соответствии с требованиями надлежащей лабораторной практики...

Еще

Микроорганизмы, микробиота, микробный статус, загрязнение, биомаркеры, формирование биопленки, методы восстановления, анализ микробиологического риска

Короткий адрес: https://sciup.org/142224442

IDR: 142224442   |   DOI: 10.21668/health.risk/2020.2.10

Список литературы Бактериальные профили и фенотипические биомаркеры изолятов микробиоты среды обитания: факторы идентификации опасности

  • Next generation of microbiological risk assessment: Potential of omics data for exposure assessment / H.M.W. Den Besten, A. Amézquita, S. Bover-Cid, S. Dagnas, M. Ellouze, S. Guillou, G. Nychas, C. O'Mahony [et al.] // Int. J. of Food Microbiol. - 2018. - Vol. 20, № 287. - P. 18-27. DOI: 10.1016/j.ijfoodmicro.2017.10.006
  • Next generation of microbiological risk assessment: Potential of omics data for hazard characterization / N. Haddad, N. Johnson, S. Kathariou, A. Métris, T. Phister, A. Pielaat, C. Tassou [et al.] // Int. J. of Food Microbiol. - 2018. - Vol. 20, № 287. - P. 28-39. DOI: 10.1016/j.ijfoodmicro.2018.04.015
  • Vouga M., Greub G. Emerging bacterial pathogens: the past and beyond // Clin. Microbiol. Infect. - 2016. - Vol. 22, № 1. - P. 12-21. DOI: 10.1016/j.cmi.2015.10.010
  • Fournier P.E., Drancourt M., Raoult D. New laboratory tools for emerging bacterial challenges // Clin. Infect. Dis. - 2017. - Vol. 15, № 65 (1). - P. S39-S49. DOI: 10.1093/cid/cix405
  • Методы общей бактериологии / под ред. Ф. Герхардта [и др.]. - М.: Мир, 1984. - Т. 3. - 536 с.
  • Методы оценки эпидемиологической значимости условно патогенной микрофлоры / О.Е. Нежвинская, Н.В. Дудчик, Н.Д. Коломиец, О.В. Тонко, Е.В. Дроздова // Здоровье и окружающая среда: сборник научных трудов / под ред. С.И. Сычика. - Минск: РНМБ, 2015. - Т. 1, № 25. - С. 69-71.
  • Methods for recovering microorganisms from solid surfaces used in the food industry: a review of the literature / R. Ismail, F. Aviat, V. Michel, I. Le Bayon, P. Gay-Perret, M. Kutnik, M. Fédérighi // Int. J. Environ. Res. Public Health. - 2013. - Vol. 10, № 11. - P. 6169-6183.
  • DOI: 10.3390/ijerph10116169
  • Fungal and Bacterial Communities in Indoor Dust Follow Different Environmental Determinants / F. Weikl, C. Tischer, A.J. Probst, J. Heinrich, I. Markevych, S. Jochner, K. Pritsch // PLoS One. - 2016. - Vol. 21, № 11 (4). - P. e0154131.
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0154131
  • Shift in the microbial community composition of surface water and sediment along an urban river / L. Wang, J. Zhang, H. Li, H. Yang, C. Peng, Z. Peng, L. Lu // Science of The Total Environ. - 2018. - Vol. 15, № 627. - P. 600-612.
  • DOI: 10.1016/j.scitotenv.2018.01.203
  • The microbiota of recreational freshwaters and the implications for environmental and public health / C.S. Lee, M. Kim, C. Lee, Z. Yu, J. Lee // Front. Microbiol. - 2016. - Vol. 7. - P. 1826.
  • DOI: 10.3389/fmicb.2016.01826
  • Gorham T., Lee J. Pathogen loading from Canada geese faeces in freshwater: potential risks to human health through recreational water exposure // Zoonoses Public Health. - 2016. - Vol. 63, № 3. - P. 177-190.
  • DOI: 10.1111/zph.12227
  • Colonization and succession of hospital-associated microbiota / S. Lax, D. Smith, N. Sangwan, K. Handley, P. Larsen, M. Richardson, S. Taylor, E. Landon [et al.] // Sci. Transl. Med. - 2017. - Vol. 9, № 391. - P. eaah6500.
  • DOI: 10.1126/scitranslmed.aah6500
  • Assessment of bioaerosol particle characteristics at different hospital wards and operating theaters: A case study in Tehran / F. Bolookat, M.S. Hassanvand, S. Faridi, M. Hadei, M. Rahmatinia, M. Alimohammadi // MethodsX. - 2018. - Vol. 5. - P. 1588-1596.
  • DOI: 10.1016/j.mex.2018.11.021
  • Fujiyoshi S., Tanaka D., Maruyama F. Transmission of airborne bacteria across built environments and its measurement standards: a review // Front. Microbiol. - 2017. - Vol. 8. - P. 2336.
  • DOI: 10.3389/fmicb.2017.02336
  • Detection of alpha-toxin and other virulence factors in biofilms of Staphylococcus aureus on polystyrene and a human epidermal model / P.M. Den Reijer, E.M. Haisma, N.A. Lemmens-den Toom, J. Willemse, R.I. Koning, J.A. Demmers, D.H. Dekkers, E. Rijkers [et al.] // PLoS ONE. - 2016. - Vol. 11. - P. e0145722.
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0145722
  • Identification and characterization of Staphylococcus aureus strains with an incomplete hemolytic phenotype / H. Zhang, Y. Zheng, H. Gao, P. Xu, M. Wang, A. Li, M. Miao, X. Xie [et al.] // Front. Cell Infect. Microbiol. - 2016. - Vol. 6. - P. 146.
  • DOI: 10.3389/fcimb.2016.00146
  • A new perspective on microbial landscapes within food production / N.A. Bokulich, Z.T. Lewis, K. Boundy-Mills, D.A. Mills // Curr. Opin. Biotechnol. - 2016. - Vol. 37. - P. 182-189.
  • DOI: 10.1016/j.copbio.2015.12.008
  • Environmental microbiota drives microbial succession and metabolic profiles during chinese liquor fermentation / X. Wang, H. Du, Y. Zhang, Y. Xu // Appl. Environ. Microbiol. - 2018. - Vol. 84, № 4. - P. e02369-e02417.
  • DOI: 10.1128/AEM.02369-17
  • Карташова О.Л., Уткина Т.М. Регуляция персистентных свойств микроорганизмов факторами различной природы (обзор) // Бюллетень Оренбургского науч. центра УрО РАН. - 2013. - С. 1-11.
  • Distinguishing between resistance, tolerance and persistence to antibiotic treatment / A. Brauner, O. Fridman, O. Gefen, N.Q. Balaban // Nat. Rev. Microbiol. - 2016. - Vol. 14. - P. 320-330.
  • Human pathogens in plant biofilms: formation, physiology, and detection / E. Ximenes, L. Hoagland, S. Ku, X. Li, M. Ladisch // Biotechnol. Bioeng. - 2017. - Vol. 114, № 7. - P. 1403-1418.
  • DOI: 10.1002/bit.26247
  • Дудчик Н.В. Изучение свойств консорциума почвенных микроорганизмов как тест-объектов для оценки интегральной токсичности // Гигиена и санитария. - 2012. - Т. 91, № 5. - С. 82-84.
Еще
Статья научная